Мир изменился после финала первого турнира. Победа Земного Царства над силами Внешнего Мира остановила неминуемое вторжение, но не уничтожила угрозу. Слухи о новом, теневом турнире, организованном из глубин запретного измерения Адскейп, начинают распространяться среди избранных бойцов. Этот турнир не подчиняется правилам древних богов, и в нём можно убивать без последствий, вызывать демонов, и даже изменять ход времени. Главный герой, Коул Янг, всё ещё осмысливает своё предназначение. Он тренируется под руководством Лю Кана, теперь ставшего Великим Защитником Земли, и Сони Блейд, вернувшейся к спецоперациям. В это время в Внешнем Мире новый правитель — Ашарак, пожиратель душ, поднимается из руин Императорского Двора. Он предлагает организовать теневой турнир, где победитель получит артефакт вечной силы — Кровавую Сферу Шиннока, способную вернуть к жизни даже павших богов и дать власть над всеми реальностями.